Michael Kritschgau, ein Mitarbeiter des Pentagon, erklärt Mulder, dass er und Scully seit Jahren von der Regierung bewusst in die Irre geführt werden. Kurz darauf entdeckt Mulder zudem, dass er überbewacht wird. In einem Handgemenge tötet er den Beschatter. Bei dem Toten findet Mulder Hinweise, die belegen, dass auch das FBI selbst in die Sache verwickelt ist.
Die 14-jährige Grace hat durch einem Reitunfall körperliche und seelische Wunden. Auch ihr Pferd Pilgrim hat schwere psychische Schäden davongetragen: Es lässt - wie Grace - keinen Menschen an sich heran. Graces Mutter ahnt, dass die Genesung von Pilgrim eng mit dem Wohlergehen ihrer Tochter zusammenhängt. Pferdeflüsterer Tom Booker erklärt sich unter einer Bedingung bereit, mit Pilgrim zu... Der Pferdeflüsterer